Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPINK4O60575 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms