Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRGAP3O43295 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms