Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBDO15205 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBDO15205 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBDO15205 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBDO15205 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBDO15205 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBDO15205 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UBDO15205 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBDO15205 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBDO15205 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBDO15205 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBDO15205 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBDO15205 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBDO15205 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBDO15205 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBDO15205 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms