Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE40O14503 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms