Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DFFAO00273 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DFFAO00273 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DFFAO00273 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DFFAO00273 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DFFAO00273 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DFFAO00273 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DFFAO00273 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DFFAO00273 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DFFAO00273 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms