Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX39AO00148 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms