Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HHLA1C9JL84 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HHLA1C9JL84 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms