Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms