Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms