Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF316A6NFI3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF316A6NFI3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms