Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L4A6NCW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms