Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POTEFA5A3E0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEFA5A3E0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEFA5A3E0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEFA5A3E0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEFA5A3E0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEFA5A3E0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POTEFA5A3E0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms