Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRD1A4D1F6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRRD1A4D1F6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms