Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCN10AQ9Y5Y9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN10AQ9Y5Y9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms