Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KNSTRNQ9Y448 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms