Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMED7Q9Y3B3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMED7Q9Y3B3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms