Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHDC2Q9Y2U9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms