Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM2AQ9Y2K7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM2AQ9Y2K7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms