Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP11BQ9Y2G3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP11BQ9Y2G3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms