Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC2Q9Y235 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC2Q9Y235 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms