Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNQ9UQP3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNQ9UQP3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms