Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNND2Q9UQB3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms