Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AMFRQ9UKV5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms