Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSPAN16Q9UKR8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN16Q9UKR8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms