Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHIC2Q9UKJ5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms