Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGA2Q9UJY4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GGA2Q9UJY4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms