Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms