Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XCL2Q9UBD3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms