Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKD2L1Q9P0L9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD2L1Q9P0L9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms