Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms