Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms