Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBM28Q9NW13 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms