Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTNNBIP1Q9NSA3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNNBIP1Q9NSA3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms