Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGEF3Q9NR81 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGEF3Q9NR81 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms