Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LHX9Q9NQ69 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms