Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRM3Q9NNZ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM3Q9NNZ6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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