Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KIAA1549Q9HCM3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms