Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD3Q9H7E2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms