Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCAS3Q9H6U6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms