Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC86Q9H6F5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC86Q9H6F5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms