Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1EQ9GZS1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1EQ9GZS1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms