Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT27Q9BW83 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT27Q9BW83 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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