Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms