Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRDL1Q9BU40 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRDL1Q9BU40 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms