Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms