Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MYD88Q99836 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms