Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITX2Q99697 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITX2Q99697 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms