Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP88Q99567 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP88Q99567 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms