Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
UHRF1Q96T88 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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