Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP2Q96SN8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP2Q96SN8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms